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水稻Rac家族新成员osRACB基因的克隆及结构分析

时间:2010-11-29  来源:中国科学(生命科学)  编辑:  浏览:330次
水稻Rac家族新成员osRACB基因的克隆及结构分析摘要Rac基因是植物中惟的类分布广泛的信号GTP结合蛋白,它在整个植物生长发育过程中起着极为重要的作用.应用本实验室已有的水稻光周期育性转换相关基因osRACD为探针,在低严谨杂交条件下,筛选农垦N-LD雌雄蕊形成期第Ⅳ期幼穗cDNA文库,获得水稻Rac家族新基因.经同源性比较和序列分析显示,该基因与玉米Rac家族成员R
水稻Rac家族新成员osRACB基因的克隆及结构分析摘要
  Rac基因是植物中惟一的一类分布广泛的信号GTP结合蛋白, 它在整个植物生长发育过程中起着极为重要的作用. 应用本实验室已有的水稻光周期育性转换相关基因osRACD为探针, 在低严谨杂交条件下, 筛选农垦58N-LD雌雄蕊形成期(第Ⅳ期)幼穗cDNA文库, 获得一水稻Rac家族新基因. 经同源性比较和序列分析显示, 该基因与玉米Rac家族成员RACB基因具有93%的核苷酸同源性, 且两者氨基酸序列长度相等, 仅存在一个氨基酸残基差异, 故命名新基因为osRACB. 进一步应用PCR技术, 以农垦58N基因组DNA为模板扩增得到长度为2930 bp的osRACB基因转录区核苷酸序列, 其结构包含7个外显子和6个内含子, 同时, 通过基因组文库筛选获得osRACB基因的启动区序列. Southern杂交分析表明osRACB基因同其他Rac基因相似, 是低拷贝基因. RT-PCR检测显示osRACB基因在水稻根、茎、叶中均有一定的表达, 但在茎中表达量最高. 此外, 还以人Rac1蛋白为模板, 利用InsightII软件包下的Homology, Discover等模块对osRACB蛋白进行了三级结构预测.
  关键词
  水稻 Rac家族 基因克隆 osRACB

植物数量性状基因定位研究概述

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