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新计算技术识别林木发育转换时间点

时间:2016-03-29  来源:中国绿色时报  编辑:梁丹  浏览:94次
计算生物学研究团队打破传统的对发育转换的理解,认为发育转换的发生是个连续的非离散的过程…植物内部存在种孕育发育转换指令植物从幼年期向成年期过渡的推手…通过与南京林业大学合作,该项技术已成功地应用于发现杨树树干生长的发育转换时间节点,以及调控这些时间节点的关键qtl…这项技术由北林大计算生物学中心博士生姜立波在其导师邬荣领教授的指导下所创建,青年教师叶梅霞等参与模型构建…
新计算技术识别林木发育转换时间点

北京林业大学计算生物学中心研究团队近日发明一种能识别林木发育转换时间节点的计算技术。该项技术已在国际著名植物学刊物《new phytologist》上在线发表。

发育转换是植物学研究的一个重要概念,它着重探讨植物从幼苗期向成年期过渡、从营养生长向有性生殖过渡的生物学机理。传统的发育转换概念是研究植物形态性状的离散型变异,比如,同一株植物不同年龄、不同部位的叶片形态存在显著差异,同一株植物花枝与营养枝存在显著差异。计算生物学研究团队打破传统的对发育转换的理解,认为发育转换的发生是一个连续的、非离散的过程。植物内部存在一种孕育发育转换、指令植物从幼年期向成年期过渡的推手。该团队充分利用自身在统计建模中的优势,把具有生物学意义的数学模型巧妙引进发育转换研究,成功推导出发育转换发生的关键时间节点,并利用全基因组关联分析方法捕获决定发育转换发生的关键qtl。

通过与南京林业大学合作,该项技术已成功地应用于发现杨树树干生长的发育转换时间节点,以及调控这些时间节点的关键qtl。这项技术由北林大计算生物学中心博士生姜立波在其导师邬荣领教授的指导下所创建,青年教师叶霞等参与模型构建。

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